Omica, modellazione predittiva e supporto sanitario di precisione
Cosa facciamo
Supportiamo team traslazionali, gruppi biotecnologici e farmaceutici, clinici, ricercatori accademici, PI, postdoc e aziende med-tech con analisi bioinformatiche e omiche specialistiche e traduzione della conoscenza in ogni fase di un progetto, tra cui:
- Supporto sanitario traslazionale e di precisione
- Dati Omics e pipeline personalizzate
- Modellazione predittiva e analisi avanzate
- Progettazione dello studio, controllo qualità e riproducibilità
1. Supporto sanitario traslazionale e di precisione
Aiutiamo i team traslazionali e i medici a trasformare i dati omici, clinici e digitali in risultati chiari e fruibili per il supporto decisionale.
Progetti tipici
- Scoperta di biomarcatori e firme geniche per la diagnosi o la prognosi
- Pannelli di farmacogenomica e interazione farmaco-gene
- Coorti con dati clinici, omici e sul microbioma
- Integrazione di dati indossabili o di app con marcatori di laboratorio e omici
Risultati pratici
- Pannelli di biomarcatori e firme geniche convalidati
- Strumenti di stratificazione del rischio (punteggi e valori limite) inclusi i punteggi di rischio poligenico
- Rapporti incentrati su PGx e raccomandazioni del panel
- Modelli microbioma-ospite per la risposta o il rischio di riacutizzazione
- Dashboard semplici e viste riepilogative per gli stakeholder non bioinformatici
- Documentazione adatta per team normativi, etici o clinici
2. Dati omici e pipeline personalizzate
Progettiamo ed eseguiamo pipeline di analisi personalizzate in base al progetto del tuo studio, al tuo organismo e alle tue domande. Dai dati FASTQ grezzi ai set di dati puliti e pronti per l'analisi, ci occupiamo dell'allineamento, della quantificazione, del controllo qualità e della documentazione.
Progetti tipici
- Trascrittomica: RNA-seq in massa e a singola cellula, set di dati time-course, trascrittomica spaziale
- Epigenomica: CUT&Tag / CUT&RUN, ChIP-seq
- Metagenomica / microbioma: profilazione tassonomica, profilazione funzionale
- Integrazione multi-omica: combinazione di dati genomici, trascrittomici, epigenetici e fenotipici
- WGS / WES: pipeline di chiamata e annotazione delle varianti
Risultati pratici
- Espressione differenziale e progettazione del contrasto
- Clustering, UMAP e altri incorporamenti
- Traiettoria/pseudotempo e velocità dell'RNA (ove supportato)
- Comunicazione cellula-cellula (analisi ligando-recettore)
- Analisi spaziale (quartieri, DE spaziale, deconvoluzione)
- Chiamata e annotazione di picco, scoperta di motivi, reti di regolamentazione
- Integrazione multi-omica (ad esempio RNA ATAC varianti)
3. Modellazione predittiva e analisi avanzata
Andiamo oltre gli elenchi di geni di base per fornire modelli predittivi che rispondono a domande biologiche/cliniche concrete.
Cosa offriamo
- Previsione della risposta al farmaco (multi-omica singola cellula, ove disponibile)
- Modelli di risposta e tossicità dell'immunoterapia
- Modelli multi-omici di rischio, progressione e stratificazione
- Modellazione predittiva microbioma-ospite
- Modelli di punteggio di rischio poligenico (PRS)
Ti aiutiamo a scegliere i metodi giusti e a interpretare i risultati nel contesto del tuo sistema.