Omics, prädiktive Modellierung und Unterstützung der Präzisionsmedizin

Was wir tun

Wir unterstützen translationale Teams, Biotech- und Pharmaunternehmen, Kliniker, akademische Forscher, Projektleiter, Postdoktoranden und Medizintechnikunternehmen mit Expertenwissen in den Bereichen Bioinformatik und Omics-Analysen sowie Wissenstransfer in jeder Projektphase, einschließlich:

  1. Translationale und präzisionsmedizinische Unterstützung
  2. Omics-Daten & benutzerdefinierte Pipelines
  3. Prädiktive Modellierung und fortgeschrittene Analysen
  4. Studiendesign, Qualitätskontrolle und Reproduzierbarkeit

1. Translationale und präzisionsmedizinische Unterstützung

Wir helfen translationalen Teams und Klinikern dabei, Omics-, klinische und digitale Daten in klare, umsetzbare Ergebnisse zur Entscheidungsfindung zu verwandeln.


Typische Projekte

  • Entdeckung von Biomarkern und Gensignaturen für Diagnostik oder Prognose
  • Pharmakogenomik- und Arzneimittel-Gen-Interaktionspanels
  • Kohorten mit klinischen, Omics- und Mikrobiomdaten
  • Integration von Wearables- oder App-Daten mit Labor- und Omics-Markern

Praktische Ergebnisse

  • Validierte Biomarker- und Gensignatur-Panels
  • Risikostratifizierungsinstrumente (Scores und Grenzwerte) einschließlich polygener Risikoscores
  • PGx-fokussierte Berichte und Empfehlungen von Expertengremien
  • Mikrobiom-Wirt-Modelle für die Reaktion oder das Risiko eines Krankheitsschubs
  • Einfache Dashboards und Übersichtsansichten für Nicht-Bioinformatiker
  • Dokumentation, die für regulatorische, ethische oder klinische Teams geeignet ist
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2. Omics-Daten & benutzerdefinierte Pipelines

Wir entwerfen und betreiben Analyse-Pipelines, die auf Ihr Studiendesign, Ihren Organismus und Ihre Fragestellungen zugeschnitten sind. Von rohen FASTQ-Datensätzen bis hin zu bereinigten, analysebereiten Datensätzen kümmern wir uns um Alignment, Quantifizierung, Qualitätskontrolle und Dokumentation.


Typische Projekte

  • Transkriptomik: Bulk- und Einzelzell-RNA-Sequenzierung, Zeitreihendatensätze, räumliche Transkriptomik
  • Epigenomik: CUT&Tag / CUT&RUN, ChIP-seq
  • Metagenomik / Mikrobiom: taxonomische Profilierung, funktionelle Profilierung
  • Multi-Omics-Integration: Kombination von Genomik-, Transkriptomik-, Epigenetik- und Phänotypdaten
  • WGS / WES: Pipelines zur Variantenerkennung und -annotation

Praktische Ergebnisse

  • Differenzielles Ausdrucks- und Kontrastdesign
  • Clustering, UMAP und andere Einbettungen
  • Trajektorie / Pseudozeit und RNA-Geschwindigkeit (sofern unterstützt)
  • Zell-Zell-Kommunikation (Ligand-Rezeptor-Analysen)
  • Räumliche Analyse (Nachbarschaften, räumliche DE, Dekonvolution)
  • Peak-Identifizierung und -Annotation, Motivfindung, regulatorische Netzwerke
  • Multi-Omics-Integration (z. B. RNA ATAC Varianten)
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3. Prädiktive Modellierung und fortgeschrittene Analyse

Wir gehen über einfache Genlisten hinaus und liefern Vorhersagemodelle, die konkrete biologische/klinische Fragen beantworten.


Unser Angebot

  • Vorhersage des Ansprechens auf Medikamente (Multi-Omics Einzelzellanalyse, sofern verfügbar)
  • Modelle für Immuntherapie-Ansprechen und Toxizität
  • Multi-Omics-Risiko-, Progressions- und Stratifizierungsmodelle
  • Vorhersagemodellierung der Wechselwirkung zwischen Mikrobiom und Wirt
  • Polygene Risikoscore-Modelle (PRS)


Wir helfen Ihnen, die richtigen Methoden auszuwählen und die Ergebnisse im Kontext Ihres Systems zu interpretieren.


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